Synchytrium endobioticum يسبب مرض ثؤلول البطاطس. Synchytrium endobioticum هو طفيل إلزامي لا ينتج خيوطًا بل sporangia، والتي تحتوي على أبواغ حيوانية متحركة. sporangia الصيف رقيقة الجدران وقصيرة العمر. تتشكل في أنسجة البطاطس وتؤدي إلى ظهور عدوى جديدة بالحيوانات. تكون جراثيم الراحة (التي يشار إليها أحيانًا باسم sporangia الشتوية أو جراثيم الشتاء أو صوري الشتاء أو صوري الشتاء) ذات جدران سميكة وتظل قابلة للحياة لفترات طويلة للغاية حتى في حالة عدم وجود مضيف. يمكن إنتاجها طوال موسم النمو. يتم إطلاقها من الثآليل المتحللة في التربة. تشخيص S. endobioticum يتعلق بكل من النبات، الذي قد تكونت عليه الثآليل، والتربة، التي قد تكون
تحمل جراثيم الراحة.
تم وصف العديد من الأنماط المرضية (الأجناس) في S. إندوبيوتيكوم تُعرَّف هذه الأنماط المرضية بحسب ضراوتها على أصناف البطاطا المختلفة. نادرًا ما يُبلَّغ حاليًا عن إصابة النمط المرضي 1 (D1) للبطاطا في أوروبا، نظرًا لقلة أصناف البطاطا المعرضة له، ويعود ذلك على ما يبدو إلى وجود مقاومة سائدة في النبات المضيف. أما الأنماط المرضية الأخرى، فقد أُبلغ عنها مؤخرًا بأنها أكثر شيوعًا في أوروبا الغربية، وتوجد بشكل خاص في المناطق الجبلية الممطرة في وسط وشرق أوروبا. كما توجد أيضًا خارج أوروبا (مثل نيوفاوندلاند، كندا، والجزء الآسيوي من تركيا). تُعد مقاومة هذه الأنماط المرضية نادرة، مما يجعل مكافحتها أكثر صعوبة. تُفرَّق الأنماط المرضية الأخرى غير 1 (D1) من خلال اختلاف ضراوتها على أصناف محددة من البطاطا، ولكنها تبدو، بخلاف ذلك، أكثر ارتباطًا ببعضها البعض من ارتباطها بالنمط المرضي 1 (D1). التدابير الداخلية الموصى بها في EPPO تشترط الدول تحديد الأنماط المرضية.
يمكن تأكيد هوية الجراثيم الصيفية أو الجراثيم أثناء الراحة التي تمت ملاحظتها تحت المجهر بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي،
وفي الوقت الحقيقي PCR. يعتمد PCR التقليدي على المباعد الداخلي المكتوب لمنطقة DNA الريبوسوم (ITS) مع التلدين الأمامي إلى ITS1 والتمهيدي العكسي التلدين إلى ITS2. في الوقت الحقيقي PCR لفان جينت بيلزر وآخرون. (2010) يعتمد على ITS2. في الوقت الحقيقي PCR لسميث وآخرون. (2014) الموصوف هنا يعتمد على وحدة فرعية صغيرة (SSU) من الريبوسوم
الحمض النووي (18S rDNA). تم تطوير PCR في الوقت الحقيقي بواسطة Bonants et al. (2015) يعتمد على النمط المرضي 1 (D1) المرتبط بتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) والذي تم تحديده باستخدام تحليل تقليل التعقيد للتسلسلات متعددة الأشكال (CRoPS). عند استخدام مادة ثؤلول البطاطس، يتم استخدام تحكم العزل الإيجابي الداخلي الذي يستهدف جين COX النباتي لمراقبة فعالية عزل الحمض النووي. يمكن تمييز النمط المرضي 1 (D1) عن الأنماط المرضية 2 (G1) و6 (O1) و18 (T1) على الأقل بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي.
المرجع: م 7/ 28 (2) Synchytrium endobioticum. EPPO نشرة، 47: 420-440. https://doi.org/10.1111/epp.12441
